馬雅各醫生,一人兼兩職,負責宣教及醫療,初時規模小,採「禮拜堂兼診所」模式是可理解的。馬醫生於1865年7月轉到旗後,經過一年多之後,於1866年9月在新建禮拜堂之對面,開設一所可容8名患者的醫館。這是一個進步,也可以說是台灣西式醫院的誕生。這個消息見於馬醫生10月20日的報告函(函稱3、4星期前開設。The
Messenger, January1867,p.21)函裡又謂:「就醫的許多患者,也有來自澎湖者。」或者我該提一提,中國海關於1866年6月聘一位醫員(Medical
Officer)駐打狗(旗後)。醫員的主要業務是診療外籍人士及作氣象報告。應聘來者是萬巴德醫生(Dr.
Patrick Manson, 1844-1922),是馬雅各醫生所推薦的,在任中與馬醫生合作無間。(1869年馬醫生回往府城,馬醫生之旗後醫館就是託萬醫生來維持的)。1871年萬醫生轉往廈門,1883年轉往香港,1890年返國。在台時就研究痲瘋(癩病),象皮病.Malaria等,後來被稱為「熱帶醫學之父」,他曾設香港醫學會(1886年)、香港醫學院(1887年)、倫敦熱帶病醫學校(1898年)等。
接替萬巴德醫生的,就是其弟萬大衛醫生(Dr. David Manson),至1875年離開打狗;很不幸,於1878年客死於福州(傳言在cricket遊技中患日射病而亡,或傳溺死云)。繼任者是連多馬醫生(Dr.
Thomas Rennie),1875年來任;繼連醫生者是梅醫生(Dr.
W. W. Myers),1879-1886年在任。在他任內完成一所設備良好的萬大衛紀念醫院(David
Manson Memorial Hospital)—中文名稱「慕德醫院」,慕德醫院,有附設醫學課程,是台灣西式醫學的濫觴。
杜聰明博士創設高雄醫學院,屢次講演提起這些史實,勉其師生云:高雄是台灣西洋醫學之基點。可稱為世界熱帶醫學之發祥地!
擔任申國海關的醫員,都有義務向總稅務司提出轄區的衛生、醫療、氣候之報告。台灣共有4份。經常是打狗及台灣府(台南)一份,淡水及雞籠(基隆)一份。這些報告。見於歷年海關報告(Customs Gazette)裡的Medical Report(報文或稱Report on the Health of……),是要解明當時各地衛生醫療的最好資料。